Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC11Q96DB2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms