Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNERQ8NFT8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNERQ8NFT8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms