Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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