Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SYT9Q86SS6 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SYT9Q86SS6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SYT9Q86SS6 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SYT9Q86SS6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SYT9Q86SS6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SYT9Q86SS6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SYT9Q86SS6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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