Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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