Protein–RNA interactions for Protein: Q69YL0

NCBP2-AS2, Uncharacterized protein NCBP2-AS2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2-AS2Q69YL0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCBP2-AS2Q69YL0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCBP2-AS2Q69YL0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms