Protein–RNA interactions for Protein: Q693B1

KCTD11, BTB/POZ domain-containing protein KCTD11, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD11Q693B1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCTD11Q693B1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCTD11Q693B1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms