Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms