Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms