Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms