Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms