Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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