Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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RTN1Q16799 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTN1Q16799 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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