Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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