Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NTRK2Q16620 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NTRK2Q16620 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NTRK2Q16620 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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