Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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