Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms