Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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VPS72Q15906 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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VPS72Q15906 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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VPS72Q15906 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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VPS72Q15906 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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VPS72Q15906 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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VPS72Q15906 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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