Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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