Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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