Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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