Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PTPN13Q12923 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPN13Q12923 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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