Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.8 ms