Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TROQ12816 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TROQ12816 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TROQ12816 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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