Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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