Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K2

KLHL30, Kelch-like protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL30Q0D2K2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL30Q0D2K2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms