Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms