Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms