Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms