Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms