Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREMQ03060 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms