Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms