Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms