Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms