Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOSBP53539 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOSBP53539 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOSBP53539 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOSBP53539 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOSBP53539 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOSBP53539 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOSBP53539 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOSBP53539 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOSBP53539 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms