Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms