Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms