Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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