Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATMP50440 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATMP50440 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GATMP50440 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms