Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms