Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRCC3P46736 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRCC3P46736 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRCC3P46736 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRCC3P46736 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRCC3P46736 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRCC3P46736 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms