Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms