Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms