Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms