Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCKARP32238 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCKARP32238 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCKARP32238 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCKARP32238 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCKARP32238 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCKARP32238 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCKARP32238 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCKARP32238 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCKARP32238 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms