Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFNP31947 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFNP31947 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFNP31947 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFNP31947 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms