Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKBIAP25963 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms