Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPREP23469 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPREP23469 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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