Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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