Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF3P18847 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF3P18847 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF3P18847 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF3P18847 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF3P18847 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF3P18847 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATF3P18847 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATF3P18847 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATF3P18847 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATF3P18847 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms